منهج التحقيق 1 - نظمت النص بما يفيد اظهار معانيه ووضع النقط والفواصل وهي عملية ليست سهلة إذا علمنا أن النص جاء متتاليا من غير عناية بذلك . 2 - دونت خصائص وفوائد كل مادة طبية ذكرها المؤلف في الكتاب وأوجزت القول في منافعها وكان جل اعتمادي في هذا العمل على كتاب منافع الأغذية ودفع مضارها للرازي والجامع لمفردات الأدوية والأغذية لابن البيطار وكتاب المعتمد في الأدوية المفردة للملك المظفر الرسولي فيما يتعلق بالمواد الطبية النباتية وبعض الأحجار والمعادن اما فيما يتعلق بالأحجار الكريمة وخواصها فرجعت أيضا إلى كتب الأحجار أمثال : كتاب الجواهر وصفاتها . وكتاب الجماهر في معرفة الجواهر للتيفاشي وكتاب نخب الذخائر في أحوال الجواهر لابن الأكفاني صاحبنا ، وذلك بناء على رغبة السيد رئيس المركز لاتمام الفائدة للقراء الذين لا تتوفر لديهم هذه الكتب . 3 - عرفت بالأماكن والمدن والمواضع التي وردت في هذا الكتاب وكذلك بالاعلام الذين ذكرهم المؤلف أو انتقى من مؤلفاتهم . 4 - شرحت الالفاظ اللغوية التي وردت في متن الكتاب والتي تحتاج إلى شرح وأحلت في ذلك إلى أمهات معاجم اللغة أمثال : لسان العرب لابن منظور ، وتاج العروس للزبيدي وغيرهما . 5 - عرفت بالأمراض والمصطلحات الطبية الواردة في الكتاب والتي تحتاج إلى تعريف أو شرح وذلك بالرجوع إلى الكتب المعنية في هذا الفن وهي كثيرة ومدونة في هامش الصفحات . 6 - وضعت أرقاما لاوراق المخطوطة داخل النص بين قوسين تسهيلا لمن أراد الرجوع إلى المخطوطة . 7 - صنعت أربعة فهارس وألحقتها بنهاية الكتاب : الأول للمصطلحات